韓國中央選舉管理委員會6月9日承認，在6月3日舉行的地方選舉中，全國共有91個投票站出現選票短缺，較最初公布的14個大幅增加。除此以外，有地方選管會亦承認，有投票站在當日早上發現選民名冊遺漏1295名選民的姓名。

據韓媒報道，忠清北道選管會承認，有投票站在選舉當日早上發現選民名冊遺漏1295名選民的姓名，需延遲30分鐘更換名冊後才能繼續投票，估計有1至2名選民最終未能投票。

在部份票站選票短缺的問題上，據執政黨國民力量議員金相勳辦公室取得的資料，選舉當日全國共140個投票站獲追加運送約2.4萬張選票，但仍有91個投票站合共短缺7194張選票。其中26個投票站因選票不足而一度中斷投票，累計中斷時間超過10小時。首爾松坡區是重災區，共有20個投票站出現短缺，其中一個投票站中斷長達105分鐘。

選管會表示，直至選舉當日下午4時25分接獲松坡區選民投訴電話，才得知選票短缺情況。選管會就「未能迅速準確掌握情況」致歉，並宣布將於10日起成立為期十天的「選票短缺真相調查委員會」。