變種病毒|理大基因排序分析 揭社區恐現兩條變種病毒傳播鏈

撰文:鄭翠碧
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南非變種病毒襲港,理工大學的基因排序發現,東涌映灣園菲傭(第11773宗)、菲傭照顧的10個月大女嬰(第11774宗)和佐敦伯嘉士大廈的印裔男子(第11643宗)的病毒基因100%相同。
團隊指出,結果反映印裔男和東涌菲傭之間有傳播關係,但到底如何傳播、中間隔了多少代傳播者,都仍是未知之數,社區中或有不少隱形傳播者。
團隊又指,另一個變種病毒個案、居於堅尼地道8號的菲傭的基因與印裔男完全不同,而這名菲傭曾進入社區,代表社區中或有兩條變種病毒的傳播鏈。

在「B.1.351」一格中,紅色框內的是三宗基因相同的個案,而居於堅尼地道8號的菲傭就由藍色框標示,兩者的基因相差甚遠,而且菲傭的病毒較接近原始南非病毒株。而在「B.1.1.7」的一格,就是西營盤華美達酒店的另一間房的患者,顯示二人是感染英國變種病毒,而非南非。 (理大提供)

理工大學醫療科技及資訊學系副教授蕭傑恒表示,他和團隊在4月做了50多個樣本的病毒基因排序分析,昨晚通宵分析東涌映灣園菲傭的個案,結果發現她是感染南非變種病毒(B.1.351),再將她和其他南非變種病毒個案的基因作比對,證實與印裔男100%相同,並無突變。

他稱,自去年9月30日發現中環IFC一名廚師感染到尼泊爾病毒株(B.1.36.27)後,該款病毒株一直在港傳播,跳舞群組及近月的本地個案都屬這款病毒株,而IFC廚師和跳舞群組個案的病毒基因都是100%相同,反映他們是同一感染源頭,個案之間有傳播關係。現時發現到印裔男和東涌菲傭的病毒基因100%相同,也意味兩人之間有傳播關係。

蕭傑恒又指出,堅尼地道8號的菲傭曾在社區逗留數天才確診,不排除在社區內有造成傳播;而印裔男亦有傳染到他人,因此社區內有可能有兩條變種病毒傳播鏈。 (記者會片段截圖)

不過,印裔男與東涌外傭都無到過同一地點,到底二人之間如何傳播?他直言或非直接傳播,而是中間有幾代的傳播者,他解釋,由9月至今的尼泊爾病毒株在傳播時,也只是出現了數顆病毒突變,代表即使病毒傳了好多代,其基因仍有可能100%相同。他坦言希望兩人之間只是相隔兩、三代,但中間的傳播鏈是如何形成,仍有待衞生防護中心去追查。

印裔男在檢疫時入住尖沙咀華美達酒店,當局曾懷疑該酒店同層的檢疫人士傳染到印裔男,蕭傑恒取得該酒店4個病人樣本,但當中3人病毒量太低,不能分析,第11550宗個案是唯一可以做到基因排序到的個案,但結果發現這宗個案與印裔男雖然都是感染南非變種病毒,但非完全一樣,估計並非印裔男的感染源頭,但亦不能完全排除印裔男在酒店受感染。至於印裔男的女性朋友,他無取得該病人的樣本,未知基因是否完全相同。

▼4月29日,東涌映灣園第11座封區檢測,涉變種病毒個案▼

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另一方面,本港另一宗出現在社區的變種病毒個案是居於堅尼地道8號的菲傭,蕭傑恒稱,這宗個案的病毒基因顯示她都有南非變種病毒,但與印裔男之間的差異更大,二人的基因突變多於十顆。他解釋,一般病毒每個月只會有一、兩顆突變,因此當突變多於十顆時,「應該可以否定兩人之間有關。」而這名菲傭所住的西營盤華美達酒店,他取了8個樣本,另外的7人與這名外傭都不相同,找不到她在酒店內受到感染的證據,他估計這名菲傭在原居地受感染的可能性較大,因為其病毒排序較接近原始南非病毒株,而且她入院時病毒量低,CT值達到38,體內亦已有抗體,料感染日至確診日之間相距8天以上。

蕭傑恒又指出,堅尼地道8號的菲傭曾在社區逗留數天才確診,不排除在社區內有造成傳播;而印裔男亦有傳染到他人,因此社區內有可能有兩條變種病毒傳播鏈。他同意政府要求所有外傭檢測,因為來自菲律賓的患者大多感染南非變種病毒,屬較高風險。