IVE生物科技畢業生研發透過檢測泥土DNA 鑑定樹木真菌品種助診治

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熱帶風暴浪卡上周吹襲香港,本港天文台早前預測今年風季將有4至7個颱風,11月仍有機會有颱風襲港。

受真菌感染的樹木容易被強風吹倒造成意外,5名香港專業教育學院(IVE)生物科技高級文憑畢業生,花約半年時間,成功研發快速鑑定樹木真菌品種的DNA檢測方法,以及早預防、診斷和治療受感染的樹木。該研究項目早前於職業訓練局(VTC)主辦的「創意x應用」計劃中奪「卓越大奬」。

IVE生物科技高級文憑畢業生何耀忠指,團隊提取泥土中真菌的DNA,再利用分子生物技術複製並檢測DNA的序列,從而分析存在於泥土中的真菌品種。(受訪者提供)

現時樹藝師主要以目測方法辨識樹木受感染的真菌品種,或將菇菌及其孢子交由實驗室檢測,但上述方法或不夠準確,同時要待真菌長成菇時,才能辨識問題,錯過治療樹木的最佳時機。

而由IVE生物科技高級文憑畢業生鄒俊傑、歐家杰、程浩鈿、林逸華和何耀忠組成的研究團隊,成功研發以檢測泥土DNA,鑑定樹木真菌。團隊成員鄒俊傑解釋,由於部分高危真菌在長成菇菌前,已對樹木結構造成一定破壞,因此團隊想盡早得知樹木受哪種真菌感染,遂研究以泥土檢驗方法取得真菌的DNA,及早判斷真菌種類。

鄒俊傑指,團隊從泥土樣本取得真菌DNA後,再利用分子生物技術複製並檢測泥土中真菌DNA的序列,然後與基因資料庫中的真菌DNA序列作對比,從而分析存在於泥土中的真菌品種。

過程中加入「納米金粒子」 進行逾500次測試以確保準確性

另一成員歐家杰指,研發期間經歷不少挑戰,例如由於泥土含有不少化學物質會阻礙分子診斷,團隊於是參考大量文獻,發現在複製DNA過程中加入「納米金粒子」,能將複製DNA的靈敏度提升10倍,有助解決泥土中雜質帶來的假陰性問題,提升測序成功率達三成。何耀忠指,過程中最具挑戰的部分在於找出檢測過程中「納米金粒子」的合適份量和濃度等。團隊花近半年時間,利用不同泥土樣本完成超過500次測試,才能確保測試的準確性。

未來將繼續改良技術 日後應用於樹藝及檢測業界

團隊研發的檢測方法,可準確檢驗普遍存在於泥土的真菌外,亦能驗出一些可能引致樹木腐朽的真菌品種,包括Trametes cubensis(古巴栓孔菌)及Ganoderma gibbosum(有柄樹舌靈芝)等。負責帶領學生進行今次研究的IVE(柴灣)應用科學系高級講師盧廷詩表示,現時業界較少利用泥土來檢測樹木真菌,未來學系將繼續改良技術,提升其靈敏度,冀望技術日後可應用於樹藝及檢測業界。



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